Trzy ciągi wystawowe na parterze, podzielonym na mniejsze przestrzenie przeznaczone są na: kolekcję sztuki nowożytnej od baroku po czasy współczesne, Skarbiec, Biblię Guteberga, okolicznościowo inne starodruki oraz rękopisy, kolekcję tkanin, kolekcję papieską związaną z pobytem Ojca Świętego Jana Pawła II w Pelplinie oraz wystawy czasowe.
Sztuka średniowieczna eksponowana jest na pierwszym piętrze w trzech dużych ciągach wystawowych podzielonych na podokresy: XIV, XV i XVI w.
Na pierwszym piętrze znajduje się również jedna z dwóch sal przeznaczonych na wystawy czasowe. W przyszłości przejmie ona też funkcję sali audiowizualnej. | 
